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Clustergrammer——基于搜集的高维生物数据热图可视
发表日期:2019-10-31 20:55| 来源 :本站原创 | 点击数:
本文摘要:生物医学考虑范畴高通量尝试措施的多样性正正在敏捷延长。纵然数据收集的速率一向加快,咱们从这些数据中得出有用结论的才智却有所滞后。数据可视化是生物数据开头剖析的首要

  生物医学考虑范畴高通量尝试措施的多样性正正在敏捷延长。纵然数据收集的速率一向加快,咱们从这些数据中得出有用结论的才智却有所滞后。数据可视化是生物数据开头剖析的首要方法,极少常用的降维措施,比如主分量剖析(PCA)和t分散范畴嵌入算法(t-SNE),通常被用于将高维数据照射至二维或三维空间中,以达成可视化。然而,由高维空间向低维空间转换的价钱很大,通常导致音信的失落。与之相对,聚类图(clustergram)或者热图技艺可直接将数据举办可视化而无需降维。为什么OPPO不行韩剧TV。聚类图易于表明,平常操纵于生物数据可视化的印刷出书物中。

  作家使用差别的数据演示了Clustergrammer的效力:癌细胞系百科全书(CCLE)的基因表达数据,使用质谱剖析法从肺癌细胞系收集的原始翻译后藻饰数据,以及质谱流式细胞仪测得血液中单细胞卵白质组的原始数据。结果阐明,Clustergrammer可剖析多种生物数据,并出现基于收集的交互式可视化图表。

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(责任编辑:本站记者)
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